Tuntutan untuk menjadikan perpustakaan UIN Sunan Kalijaga sebagai perpustakaan yang terotomasi membutuhkan sistem informasi yang mendukung untuk menjalankan sirkulasi peminjaman, pengembalian, denda dan lain-lainya. Penjagaan dan pemeliharan alat (komputer) atau sistem informasi tersebut membutuhkan tenaga khusus yang fokus terhadap pemeliharaannya, maka dibentuklah bagian sistem informasi dan jaringan yang kantornya terletak di lantai satu sebelah barat gedung perpustakaan UIN Sunan Kalijaga.
adapun hal-hal yang menjadi fokus bagian ini adalah : pemeliharaan sistem sirkulasi, OPAC, Digital Library dan Web Perpustakaan, pemeliharaan dan pebaikan komputer-komputer yang berada di perpustkaan, pemeliharaan jaringan komputer agar tetap berjalan lancar.